接續之前的文章「益生菌怎麼挑，讓營養師告訴你！」，這篇文章想讓爸爸、媽媽們知道，買到了符合需求的益生菌之後，接下來益生菌怎麼吃以及怎麼保存才對呢？有了正確觀念，不只錢花得更值得、效果也更好。
益生菌怎麼吃觀念一：益生菌應該飯前吃還是飯後吃？
其實目前科學界很難有定論，到底飯前吃還是飯後吃，益生菌到達腸道的效果比較好，常有人說飯後吃比較好，因為飯前胃的消化液酸度高，大概只有pH值1至2而已，所以飯前吃的話，益生菌很容易被胃液殺死而讓效果大打折扣，不過其實只要在飯前配服比較多的水分，讓益生菌快速通過胃部，減少胃液對益生菌的傷害，飯前吃益生菌也是沒有問題的，因此益生菌應該飯前吃還是飯後吃呢？其實只要有定時食用，飯前吃或飯後吃都可以。
觀念二、益生菌一次吃足量，還是分次吃比較好？
益生菌對身體有益，但如果希望益生菌發揮更好的功效，建議分次食用會是更好的選擇，如之前的文章「益生菌怎麼挑，讓營養師告訴你！」所提，一次吃大量益生菌，過多的益生菌無法定殖於腸道會排出體外，所以一天分成兩次到三次食用，可以增加益生菌的定殖機會。另外，吃益生菌之餘，記得多吃益生質（prebiotics），也就是益生菌的食物，像是蔬菜及水果，才比較有機會讓益生菌留存在身體中。
觀念三、益生菌該怎麼保存？
保存環境的溫度越低，益生菌的活性會越低，因此有利於益生菌的保存，避免益生菌死亡的速度大於新生長的速度，所以建議益生菌應盡量放置於陰涼處。然而台灣的夏天，氣溫基本上高達30幾度，甚至有時40度以上，即使放置陰涼處，益生菌有可能活性還是過大，讓生長速度過快導致益生菌的死亡，因此春夏時期，建議益生菌產品放置在冰箱中，會是比較好的保存方式。大家也可以注意市面上的益生菌品牌，有些廠商非常注重產品的品質，將益生菌放置於低溫的倉儲環境，並且用冷藏車運送產品，以及在賣場將益生菌放置在冰箱中做販售，這樣的作法更有利於控制益生菌的生長。
觀念四、益生菌如果變死菌了還有功效嗎？
關於這一點，我們可以先了解益生菌是如何發揮功效的，益生菌一部分的功能來自於細胞內含的物質，可以激發及訓練人體的免疫反應而增加人體免疫力而來，所以即使是死掉的益生菌，因為仍然保有其可激發免疫力的物質，所以還是可以調整體質，然而活菌跟死菌相比，因為是活體，所以活菌能夠持續分泌許多的代謝產物，這些代謝產物對於人體有著許多好處，包含製造維生素K、短鏈脂肪酸等。所以食用死菌仍然有保健功效，但是產品如果保有多的活菌，對於人體有更多的好處。